Bom dia Italo,
questionei o técnico da Boa Vista de como o mesmo tinha certeza se era a aplicação que teria feito a exclusão, se ficava algum registro, log, do tipo horário que a exclusão ocorreu mas ele disse que não fica registrado isso e informou que tem recebido chamados semelhantes desse fato com frequência. Segundo o cliente que emite as NFs, o mesmo usa o certificado apenas para emissão das NFs. Para não deixar o cliente na mão, reembolsei o valor do certificado e pedi pra adquirir um A1, que não tem erro.