Bom, resolvi o problema temporariamente pra minha situação, porem não recomendo para quem vai querer fazer.
No caso o @BigWings deu a resposta para o problema, então para quem puder, siga-o.
No meu caso a versão do fastreport paga de momento é fora de cogitação ( o departamento comercial tem que aprovar, porém o problema do cliente tem que ser resolvido o mais rápido possível, já que tem carga esperando o transporte ). Para funcionar com a versão CE, eu abri o arquivo FR3, fui até a página de modal rodoviário, copiei todo o master data e passei direto para a page1, acertando a ordem de impressão. Depois apaguei a página modal rodoviario ( é necessário porque senão imprime uma página em branco só para o modal rodoviario e fica duplicado, uma na página efetiva da DAMDFe e outro na pagina em branco ).
Problema nº 1: o arquivo não fica dinâmico, ou seja, sempre irá imprimir o grupo de modal rodoviário na DAMDFe, que no meu caso só trabalhamos com clientes de porte pequeno, logo, somente modal rodoviario. E seria necessário ter um arquivo de layout para cada modal ( rodoviario, aquaviario, ferroviario, aereoviario )
Problema nº 2: o arquivo não está versionado, então sempre que a equipe do ACBr mudar o layout da DAMDFe, será necessário refazer o processo para atualizar o arquivo personalizado.
Problema nº 3: a marca d'agua de homologação sempre sai escrita, então é necessário retirar do arquivo personalizado, logo seria necessário 2 arquivos fr3 para cada modal, um com a marca d'agua de ambiente homologado e outra sem a marca d'agua.
Caso alguem necessite, segue em anexo o arquivo alterado.
Lembrando que é somente um contorno do problema e não uma solução, então reforço, se puderem, sigam a resolução do @BigWings
DAMDFe_Retrato.fr3