Italo,
Isso mesmo, estou carregando um arquivo emitido no mês 01/2012.
Não cheguei a verificar o LoadFromFile ainda, mas, após ler seu comentário verifiquei que nessa rotina também possúi o GerarCTe após a leitura do XML.
Existindo as 2 funções no componente LoadFromFile e LoadFromStream, acredito que ambas devam ter a mesma finalidade, e por consequência funcionarem da mesma forma.
Se a função GerarCTe for chamada, ela vai acabar atualizando a Chave do CTe "Importado", oque não seria o correto na minha opinião, pois o documento estaria diferente do XML gerado.