Gustavo Agostinho

Realmente, você acertou.
Consegui reproduzir os erros chamando a função SetRoundMode(rmUP)  no preenchimento do titulo.
   SetRoundMode(rmUP); //forçar o problema Titulo := aDM.ACBrBoleto.CriarTituloNaLista; ..... ..... Titulo.ValorDocumento:=FDQDadosBoletoVALOR_DOCUMENTO.AsCurrency; O meu caso eu tinha a função RoundTo5 também na emissão da NFSe. por isso logo depois da emissão deu problema no boleto e não apresentou problemas nos testes.
Quem tiver com o problema procure no código alguma função que use SetRoundMode(rmUP); Retirei a RoundTo5 de todo sistema.
Segue uma função que sempre usei desde os primórdios da NFe para arredondamento e sempre funcionou bem.
Function TBRoundTo(Value: Extended; Decimals: integer): Extended; var Factor, Fraction: Extended; begin Factor := IntPower(10, Decimals); { A conversão para string e depois para float evita erros de arredondamentos indesejáveis. } Value := StrToFloat(FloatToStr(Value * Factor)); Result := Int(Value); Fraction := Frac(Value); if Fraction >= 0.5 then Result := Result + 1 else if Fraction <= -0.5 then Result := Result - 1; Result := Result / Factor; end; Agradeço o apoio de todos. 
att
Gustavo.

Pessoal, consegui resolver.
Este caso era preciso autorizar mais sequencias de lote RPS para conversão em NFSE.
O processo é automático no site do Betha.
Segue print anexo para consulta.