Já tem um bom tempo este tópico, mas não custa deixar como resolvi o problema de conexão ao SEFAZ.
O problema era na hr de transmitir; o sistema acusava que não era possivel estabelecer a conexão a SEFAZ. No meu caso, utilizo o emissor gratuito do governo.
Dps de muitas tentativas, inclusive as mencionadas acima, fiz um backup do sistema e renomeei a pasta database (no meu caso windows, localizado em C:\database). Apos, executei o emissor pelo site da SEFAZ e fiz o restore dos dados.
Pronto, voltou a transmitir.
Se alguém estiver passando por isso, não custa tentar