Por exemplo, no Oracle, posso acessar uma tabela, e gerar um "select * from tabela" separando os atributos com ponto e vírgula.
A saída será um conjunto de linhas da tabela, para cada registro, com seus atributos separados por ";".
Penso que, se assim você proceder, após as alterações feitas no banco do MySQL, poderá gerar um novo arquivo texto, para importar novamente, mas já com as correções em bloco.
Abs,
Gustavo
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