Obrigada Caetano pela resposta,
Sim o CTe encontra-se na base nacional . Ocorre que o cte emitido no estado AM automaticamente atualiza a base nacional, porém não é encontrado quando vai ser homologado por SP, a empresa que está emitindo em SP informa que precisa que o CTe esteja na base da SP, na minha visão ele precisa estar na base Nacional.
mas está um jogo de empurra que não tem fim, de que é o erro, do CTe emitido que está na base nacional ou do CTe que está sendo emitido na base SP e não valida o outro que está em documentos anteriores.