Boa tarde @Sófolha
Obrigado pelas informações.
Conforme informado anteriormente, em casos semelhantes já relatados, enquanto ocorreu este tipo de erro com algum DFe, outros no mesmo ambiente funcionaram corretamente.
A questão não deve ser a instalação do certificado tão pouco a utilização dele pela componentes, tendo em vista que alguns DFes funcionam.
O problema deve ser algo específico entre o certificado/leitora/driver/outros X Servidor que recepciona o documento.
Tente atualizar a cadeia de certificados onde está atendendo o problema para verificar se resolve em algum dos cenários.
Segue um tópico relacionado.