Viu tu não precisa ficar postando a cada uns dias a mesma coisa espera que alguém vai responder!
se tu tá no trunk2 já deve ter usado na NF-e também isso! Também existe os fontes dos componentes que sempre é bom estudar para não passarmos de meros arrastadores de componentes!
então a diferença básica é que o libCapicomDelphiSoap faz uso das bibliotecas que já vem com o delphi para interagir com o certificado já a outra é uma que foi escrito pelo sr. Jean que é da equipe do ACBr e não faz uso dos arquivos padrões do delphi!
Corrija alguma falha que tenha cometido ao escrever mas basicamente é isso!
há vale lembrar que se usa lazarus e informa libCapicomDelphiSoap ele faz automaticamente a troca para o outro pois no lazarus não tem o código nativo igual o delphi!