Bom dia Windel,
Lembre-se que no DACTE só pode conter informações que conste no XML, idem no DAMDFE.
Se não existe uma TAG especifica para a informação desejada no XML, a solução é colocar a mesma em Observações.
Quanto a emissão do MDF-e para transporte intermunicipal vide o Ajuste SINEF 21 de 10 dezembro de 2010.
Cláusula primeira Fica instituído o Manifesto Eletrônico de Documentos Fiscais - MDF-e -, modelo 58, que deverá ser utilizado pelos contribuintes do Imposto sobre Operações Relativas à Circulação de Mercadorias e sobre a Prestação de Serviços de Transporte Interestadual e Intermunicipal e de Comunicação - ICMS, em substituição ao Manifesto de Carga, modelo 25, previsto no inciso XVIII do art. 1º do Convênio SINIEF 06/89, de 21 de fevereiro de 1989.