Na emissão da NFe quem gera o XML é você, você não recebe ele da SEFAZ.
A SEFAZ devolve apenas o protocolo de autorização, que o ACBr já se encarrega de adicionar no XML gerado, e salvar ele em disco, se a configuração pra isso estiver ativada.
A comunicação via webservice é feita com o serviço fornecido pela SEFAZ estadual.
Após a SEFAZ estadual autorizar a nota, ela deve fazer a sincronização da mesma com o Ambiente Nacional, esse processo pode demorar.
Se você teve algum problema com a autorização da NFe, basta carregar novamente o XML gerado e assinado anteriormente, e executar o método de Consulta do componente, se ela já está autorizada na SEFAZ estadual o protocolo será incluído no XML e você já tem a nota completa.