Boa tarde Jemison,
Primeiramente você não envia um lote de NFS-e e sim de RPS.
O provedor valida os RPS enviados e caso estejam OK eles serão convertidos em NFS-e e retornados para você.
Cada RPS tem que ter um numero sequencial, sendo assim ao enviar o primeiro lote com 3 RPS estes deverão ter os números: 1, 2 e 3, quando for enviar o segundo lote contendo 5 RPS (por exemplo) os seus números serão: 4, 5, 6, 7 e 8.
Alguns provedores exigem que o numero do lote também seja sequencial sendo assim no exemplo acima o primeiro Lote terá como numero o valor 1 o segundo 2 e assim por diante.
Caso algum RPS não seja validado pelo provedor, ou seja, contem alguma informação errada sempre é informado o numero do RPS.
Espero ter ajudado.